在看完片头的剧情交待后，游戏的主角LINK从睡梦中被惊醒。小精灵NAVI奉命要带LINK去见GREATDEKUTREE。至此可以操作LINK了。首先应该与村子中的各人进行对话，可以学到很多游戏中要使用到的技巧。在村子中溜达时，可找到某处墙壁的下面有一个洞，钻进去后，可在里面找到KokiriSword，这是游戏初段的武器。用这把剑多除一点草吧，别忘了拾起地上留下的赏金。当钱足够了，可在商店里买到DekuShield。装备好盾与剑后，就可以大摇大摆去见GREATDEKUTREE了。游戏中有时NAVI会出现在C组键的上键位置，此时按C组键的上键可与NAVI交谈，而她往往会给LINK很重要的提示。
见到DEKUTREE后，得知他受到了诅咒。为了帮助他，LINK奋勇地进入了大树体内。这是游戏的第一个迷宫，主要是想让大家适应游戏的操作，所以没有什么难度。需注意的是在迷宫2层(以后统称为2F，其它楼层依次类推)，有种敌人平时将脸埋在地下，等LINK一走进它就会发出攻击，对付它只需算好一定距离，将它吐出来的子弹用盾牌反弹回去即可，命中以后可以上前问话，从它的口中可得到一些提示( 以后遇到这种敌人，对话后一般都可以买点东西)。走到一处会发现上方有梯子，不过太高了，LINK不能接触到，此时可用弹弓将其击下。在有一房中，先将树枝在火把中点燃，再用它点燃另一堆火把，需注意当火把点燃后，应尽快将树枝熄灭，这样下次还可以用。经常看到墙上有爬行的小蜘蛛，用弹弓将其击毙后，可得到金色头盖骨，至于这些金色头盖骨的用处会在后面提到。当到达最上方后，可跳下将 1F地上的蜘蛛网撑破，进入地下1F。在其中看见有蜘蛛网挡路时，应该用树枝引火烧掉它，这样就可继续前进。当进行到一处感觉再没有路走时，不要气馁，抬头一看就会发现蹊跷，拔出那心爱的弹弓吧!在地下2F最后的一个房间，吐子弹三兄弟登场，用盾牌反弹法，依中右左的顺序消灭它们(这里要充分利用Z键的瞄准功能) 。轮到BOSS战了，用闪光弹令其昏厥，然后上前猛砍，它会跳上天花板下蛋，使用弹弓加Z键瞄准可轻易消灭之，几个回合即可搞掂。最后别忘了先吃大心，再进传送点哟!
出来后，得知DEKUTREE已经命不久矣，拿到他交给LINK的圣石，悲痛欲绝地离开KokiriForest。在村口遇见了与LINK青梅竹马的SARIA，她交给了LINK一支笛子，绝对重要道具终于入手!一番离别话后，开始LINK的真正冒险了!
首先应该到位于北方的HyruleCastle，注意城门只有在白天才开，所以只有白天才能入城。进城后的第一间房间里可以挣很多钱，利用打滚破坏房中的某个木箱后，可得到金色头盖骨。集市上有些小游戏，通过后可得到不错的奖励，有时间可以玩玩。从集市的正前方向城堡进发，路上会遇见一位小女孩MALON，接受她的请求，她会给LINK一颗蛋。继续前进躲过卫兵的视线，在护城河旁找到正在睡觉的 MALON她父亲，这时MALON给LINK的蛋应该已经孵化成鸡了，对着那位贪睡的父亲用鸡鸣吧。等他撤退后，就可利用两个木箱跳到对岸。然后钻进那个排水的小洞，就进入了后院。哇!睁眼一看，四下满是巡逻的卫兵，再次施展LINK那漂亮的过人动作吧!进入中庭后，遇见了游戏第二主角ZELDA公主。经过一番对话后，知道了后面的任务是寻找另外两颗圣石。从ZELDA的保镖IMPA那里学到ZELDALULLABY这首皇家专用歌后，就可以向下一个地点LonLonRanch进发了。
来到位于地图中央的LonLonRanch，首先进入左边的房间，在限定时间内抓到三只特定的鸡就可获得LonLonMilk(仔细观察开始那三只鸡落地的地方，可以轻易抓完)。在牧场中央可以学得EponaSong，以后遇见奶牛就可以吹这首歌，能得到 lonlonmilk。牧场的最里面有间房间有很多木箱，想法推开木箱，可钻入后面的小洞，从而得到小心，每找到4个这样的小心，可以使生命力加一。
接下来又马不停蹄地回到最初的KokiriForest，从村子上方可以到达TheLost Woods。这里有许多路，一旦走错就会推出从来。大家只需按照有左右左中左右的顺序就可达到SacredForestMeadow。进入最里面后，会遇见SARIA，从她那里学到 SARIASONG，以后就可以吹此歌来与她作心灵交谈。此森林中可遇到吹笛的小丑，对他们吹SARIASONG可获得小心。然后就要向KakarikoVillage前进了。
从城堡旁过桥就可达到KakarikoVillage。这里有间房子里有只大蜘蛛，它拜托 LINK帮它揭开蜘蛛们受到的诅咒。不是经常无缘无故收集到一些金色头盖骨吗?每收集到十个，就可以到这里来领到一份奖品，奖品可是非常丰厚的哟，那就抓紧时间开始收集吧!一般来说，每个村子在晚上时都会出现携带金色头盖骨的小蜘蛛，有时间的话就可以在这方面多花一点时间。村子里有位妇人在寻找她的鸡，LINK可以帮她把那些鸡找到，然后扔到鸡圈中。顺便可以学到一招以后经常用到的技巧，抓住一只鸡，然后从高的地方跳下去，可以滑很远(滑翔"鸡")。要注意，有只鸡藏在木箱中，可以用滚撞法将木箱撞破。从村子上方来到墓场，在墓场最里面最大的墓前吹ZELDA SONG，跳下随之出现的洞窟中。第一间房全灭敌军即可通过，第二件房不用管敌人冲过去，在最里面可学得SUNSONG，利用此歌可以转换白天黑夜。出来之后，先吹SUN SONG转换为黑夜，此时可以将有些墓碑拉开，其中最上面靠中间的那个墓里有小心，这需要先吹SUNSONG将僵尸击毙。回答村子中后，对守山门的门卫使用ZELDA交给 LINK的书信，门卫就会让路。可以去GoronCity了。在这之前可以到HyruleCastle 的市集面具店为这位门卫买个面具。
沿着山路来到GoronCity，在最底层的Goron王门前吹作ZELDASONG，进入之后再在Goron王面前吹SARIASONG，可得到能举起炸弹的道具。用树枝引火点燃门口的火炬后，中间的大花瓶开始旋转，到第二层将炸弹仍进花瓶中可以炸出小心。来到 GoronCity大门外，将一巨型GORON身旁的炸弹从栅栏最低的位置仍下去，可以把下面山洞口的积石炸烂。顺便在右边栅栏处用后滚翻可取得山洞上方的小心。从刚才炸开的山洞口进去，可来到DodongosCavern。此迷宫难点解析如下。要多利用炸弹将看起来有点不协调的墙壁炸烂。在1F有一处的鱼型敌人，它的主要通过自爆来攻击LINK，可利用它的这一特性将某些墙壁爆烂。有一房间围了一圈炸弹，不过仔细观察会发现最中间没有，将起房间角落的炸弹投到那一点，一串破炸声后，炸出了一阶一阶的楼梯。2F有一房间一小截楼梯上有一堵可炸烂的墙(不大容易发现)，不过墙旁没有位置放炸弹，这时可以将炸弹拿起后，多等一下，算好时间要爆时再投过去直接炸墙。在得到道具炸弹袋后，就可以身上带炸弹了，把炸弹仍进巨头像的双眼中，巨头像的嘴就会张开。进去之后会遇到本关的BOSS，将炸弹仍进它贪婪的大嘴中，一声闷响后就可以放心地猛砍它几刀。几个回合过去后，它倒下了!拾起掉落在地上的大心，进入传送点。从Goron王处取得第二颗圣石，LINK继续走向他的下一个目的地。此时，可以先到死山顶的大精灵洞窟学"超级旋风斩"(注意，山顶有两个洞，还有一个是通往火之神殿，现在不用去那里，不要走错了!站在大精灵池前三角神力的图腾处吹ZELDASONG，大精灵就会出现。)。学完绝技后，沾猫头鹰的光，鹰哥送 LINK下山，不用费脚力了!哇，更令人叫绝的是鹰哥直接把LINK运到了KakarikoVi llage一个奇爽的位置，仔细观察一下，一颗小心可谓是手到擒来。
回到HyruleCastle，穿过市集到城堡外，可发现有一大石头挡住了一个小洞，炸烂它，钻入小洞。里面的大精灵会教LINK火魔法。
穿过北东方的河流，可来到ZorasRiver。一进入即可发现有个长得十分肥胖的兄弟在那里嚼着扁豆，经过细问得知那是魔法豆，可以种植在松软的泥土中，等以后长出树后，可以通过它到更高的地方(LINK用空瓶抓的虫子也可以种在泥土中，等以后说不定有很好的结果呢)。LINK可以从他手中买到，不过这魔法豆的价钱会随LINK买的个数增多而增多。因这种道具十分重要，所以要尽量多买!这里有只鸡，设法将它一直带到小桥处，抓住它利用"滑翔鸡"原理往回飞可以取得小心;再回到开头再抓一只鸡，设法将它带到山顶瀑布处，同样利用"滑翔鸡"原理可以取得又一个小心。到达瀑布处，吹ZELDASONG可令瀑布停止，趁机冲进去可来到ZorasDomain。首先去Zora王房间左边进行跳水冒险，在限定时间内捡完钱后，可学会潜水之术，以后在水中按"A"键可以进行稍长时间的潜水。再用空瓶捉一条鲜鱼，这样就可以来到Zora王的面前了。经过询问之后，得知Zora王的女儿Ruto公主失踪了，并且接受了Zora王的委托帮他找女儿。说是可以帮他找女儿，可没有半点音讯啊。没有任何头绪的LINK正在练习潜水时，发现水下有一洞，潜进去后发现别有冬天，原来这里连通到LakeHylia。在水中发现了一个瓶子，潜水取得后，原来里面有一封Zora王女儿Ruto向有缘拾得此瓶的人求救的信。首先到岸上稻草人处，吹一首随便自创的歌，不过要记录下音调哟，要不就没有用了。七年之后，再来到这里吹这首歌就可以学会稻草人之歌。是时候将求救信拿给Zora 王看了!Zora王看了信后，挪开他那肥肿的身子腾出了一条路。由此路可来到大鱼 Jabu-Jabu的跟前，将之前捕捉到的鱼放出来，Jabu-Jabu会张开大嘴，LINK冒着可能被大鱼的胃酸腐蚀掉的危险，毅然冲了进去。看到这个迷宫的画面，你就会感到 N64机能的强大了，但千万不要被画面所吸引了，这里机关可多了!走不了多久就可看到Ruto公主，LINK想带她出去，可她却一定要找到一件东西才肯离开。没办法，只有帮忙了。走着走着，突然Ruto公主掉下了陷阱中，LINK毫不考虑也跟着跳了下去。找到Ruto后，要举着她与LINK一起前进，还要充分利用她来压机关等。这样互相帮助，两人终于回到了1F。首先要到1F的最里面右边的门里取得回旋标，然后就可以利用回旋标消灭某些房中的长柱(利用"Z"键锁定目标，然后边引诱它攻击 LINK，边用回旋标攻击)。把相应颜色的长柱破坏后，相应电流阻挡的地穴就可进入。一直往前走就会遇见本关的"小BOSS"，快速围着它转(速度要比它快)，用"Z" 键锁定目标，再用回旋标打它的后背。将小BOSS击毙后，当然就轮到真正的BOSS了。打它
